Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr326-ps1-201ENSMUST00000204790 392 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6375-201ENSMUST00000205201 1145 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms