Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms