Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms