Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 AC134917.3-201ENSMUST00000222057 1283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
P10404 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms