Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20830J3KML6 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms