Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac6Q9Z2V5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac6Q9Z2V5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms