Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd4Q9Z2D7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd4Q9Z2D7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms