Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn7Q9Z261 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms