Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Setbp1Q9Z180 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Setbp1Q9Z180 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms