Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Lemd3Q9WU40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms