Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms