Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PplQ9R269 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PplQ9R269 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PplQ9R269 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PplQ9R269 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PplQ9R269 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PplQ9R269 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms