Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn7Q9R1S8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn7Q9R1S8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms