Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zeb2Q9R0G7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zeb2Q9R0G7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zeb2Q9R0G7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms