Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nubp1Q9R060 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms