Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1aQ9QYR6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1aQ9QYR6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms