Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad18Q9QXK2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad18Q9QXK2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms