Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rai2Q9QVY8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms