Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms