Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhoaQ9QUI0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhoaQ9QUI0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms