Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rabgef1Q9JM13 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rabgef1Q9JM13 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Rabgef1Q9JM13 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rabgef1Q9JM13 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Rabgef1Q9JM13 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Rabgef1Q9JM13 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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