Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Habp4Q9JKS5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms