Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nova1Q9JKN6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms