Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scamp5Q9JKD3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms