Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube2j1Q9JJZ4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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