Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms