Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfhx4Q9JJN2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms