Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms