Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LratQ9JI60 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LratQ9JI60 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LratQ9JI60 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LratQ9JI60 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LratQ9JI60 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms