Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rb1cc1Q9ESK9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rb1cc1Q9ESK9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms