Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms