Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Barx1Q9ER42 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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