Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SgshQ9EQ08 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms