Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk1dQ9DC28 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms