Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms