Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf4Q9DAW6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf4Q9DAW6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms