Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PacrgQ9DAK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PacrgQ9DAK2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PacrgQ9DAK2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PacrgQ9DAK2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PacrgQ9DAK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms