Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc89Q9DA73 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms