Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DA42 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DA42 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DA42 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DA42 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9DA42 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9DA42 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9DA42 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9DA42 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9DA42 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms