Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Alkbh4Q9D8F1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh4Q9D8F1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms