Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arpc5lQ9D898 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arpc5lQ9D898 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms