Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms