Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Capns2Q9D7J7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capns2Q9D7J7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms