Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc8Q9D753 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms