Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc94Q9D6J3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms