Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2900055J20RikQ9D6G3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2900055J20RikQ9D6G3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms