Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms