Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms