Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syce1Q9D495 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1Q9D495 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms