Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag1Q9D3E6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms